怎樣簡單的解釋連鎖不平衡的主要概念

簡介

由于 HLA 不同基因座位的某些基因經(jīng)常連鎖在一起遺傳，而連鎖的基因并非完全隨機(jī)地組成單體型，有些基因總是較多地在一起出現(xiàn)，致使某些單體型在群體中呈現(xiàn)較高的頻率，從而引起連鎖不平衡。

折疊編輯本段解析

例如兩個(gè)相鄰的基因A B, 他們各自的等位基因?yàn)閍 b. 假設(shè)A B相互獨(dú)立遺傳，則后代群體中觀察得到的單倍體基因型 AB 中出現(xiàn)的P(AB)的概率為 P(A) * P(B).

實(shí)際觀察得到群體中單倍體基因型 AB 同時(shí)出現(xiàn)的概率為P(AB)。 若這兩對等位基因是非隨機(jī)結(jié)合的，則P(AB)≠P(A)*P(B)。計(jì)算這種不平衡程度的方法為: D = P(AB)- P(A) * P(B).

連鎖不平衡分析在連鎖不平衡程度的評估、復(fù)雜疾病精細(xì)定位以及研究人類的歷史和遷移中得到了越來越廣泛的應(yīng)用。連鎖不平衡又稱等位基因關(guān)聯(lián)(allelic association)，其原理其實(shí)很簡單。

假定兩個(gè)緊密連鎖的位點(diǎn)1，2，各有兩個(gè)等位型(A，a;B，b)，那么在同一條染色體上將有四種可能的組合方式:A-B，A-b，a-B，和a-b。

假定等位型A的頻率為Pa，B的頻率為Pb，那么如果不存在連鎖不平衡(如組成單倍型的等位型間相互獨(dú)立，隨機(jī)組合)單倍型A-B的頻率就應(yīng)為PaPb。而如果A與B是相關(guān)聯(lián)的，單倍型A-B的頻率則應(yīng)為PaPb+D，D是表示兩位點(diǎn)間LD程度的值。

如果位點(diǎn)2上的等位型B與疾病易患性有關(guān)，那么將會觀察到等位型A的頻率在病人群體中高于對照群體。換句話說，等位型A與該疾病性狀相關(guān)。

事實(shí)上，可以檢測遍布基因組中的大量遺傳標(biāo)記位點(diǎn)，或者候選基因附近的遺傳標(biāo)記來尋找到因?yàn)榕c致病位點(diǎn)距離足夠近而表現(xiàn)出與疾病相關(guān)的位點(diǎn)，這就是等位基因關(guān)聯(lián)分析或連鎖不平衡定位基因的基本思想。